RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 H2AFVQ71UI9 128 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SRLQ86TD4 932 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SLC5A5Q92911 643 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ZIM3Q96PE6 472 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TMX2Q9Y320 296 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 CYP2J2P51589 502 aa22.33■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SLC15A2Q16348 729 aa22.33■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.33■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.33■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 YDJCA8MPS7 323 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.163e-19■■■■□ 21.6
IMP4-208ENST00000460766 CES2O00748 559 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PPIP5K2O43314 1243 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 FERP16591 822 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ANXA13P27216 316 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 STAT1P42224 750 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TRADDQ15628 312 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CEP55Q53EZ4 464 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ARL8AQ96BM9 186 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PLSCR1O15162 318 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ODR4Q5SWX8 454 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PEX26Q7Z412 305 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PBKQ96KB5 322 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 MYO1CO00159 1063 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 EVI5O60447 810 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TTMPQ5BVD1 217 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CFAP58Q5T655 872 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CNKSR1Q969H4 720 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 NACC1Q96RE7 527 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 KRT14P02533 472 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ARP10275 920 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 FMO5P49326 533 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 FIZ1Q96SL8 496 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 NENFQ9UMX5 172 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SLX4Q8IY92 1834 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PPFIA4O75335 1185 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TRIM49P0CI25 452 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TRIM49CP0CI26 452 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 DAAM2Q86T65 1068 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 F8VZ95 297 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SOX5P35711 763 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CBWD6Q4V339 395 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 METTL13Q8N6R0 699 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SPDYE6P0CI01 402 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 IRAK1P51617 712 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PLS1Q14651 629 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 NFIL3Q16649 462 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 BANK1Q8NDB2 785 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 LXNQ9BS40 222 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 FAM170AA1A519 330 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ZNF131P52739 623 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 KCTD16Q68DU8 428 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 RDH13Q8NBN7 331 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 STK33Q9BYT3 514 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms