RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF862O60290 1169 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR32O75388 356 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSPG5O95196 566 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OATP04181 439 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFNP31947 248 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCN3P51790 818 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JAK3P52333 1124 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC24A5Q71RS6 500 aa29.57■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD320Q9NPF0 282 aa29.57■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HYAL1Q12794 435 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q4G0T1 1027 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB12Q6NXP0 572 aa29.56■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC45AQ9H3U1 944 aa29.56■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGB1P05556 798 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT17Q6IS24 598 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL23Q8NBE8 558 aa29.55■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJA10Q969M2 543 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM50BQ9Y247 325 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9IYK1 514 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDP2O95551 362 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP3A7P24462 503 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGCGQ16739 394 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTC1Q2NKJ3 1217 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJD3Q8N144 294 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC71Q8N4P6 559 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01465Q8N7H1 131 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPPL3Q8TCT6 385 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R2N6 131 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMD10O75832 226 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTBRP36941 435 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF710Q8N1W2 664 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RDM1Q8NG50 284 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIFM3Q96NN9 605 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBKBP1A7MCY6 615 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJB1P25685 340 aa29.52■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPY5RQ15761 445 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.52■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS10Q9H324 1103 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGFLR1Q9H665 355 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa29.52■■■□□ 2.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM189BP81408 668 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSC3Q14574 896 aa29.51■■■□□ 2.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOXD1Q6UVY6 613 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POF1BQ8WVV4 589 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AAASQ9NRG9 546 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM161AQ9NX61 479 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKL5O76039 1030 aa29.5■■■□□ 2.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT25Q7Z3Z0 450 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBOAT7Q96N66 472 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ14Q9UNX9 436 aa29.49■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PI4K2BG5E9Z4 385 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGFR1P11362 822 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRS1P35568 1242 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPC3P51654 580 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCRN1Q12765 414 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLUL1Q15846 466 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INF2Q27J81 1249 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XKR3Q5GH77 459 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM31Q5JXX7 168 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GNT9Q6UX72 402 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ETNPPLQ8TBG4 499 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCLT1Q96NL6 688 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRFN3Q9BTN0 628 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKAG3Q9UGI9 489 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01565O15544 149 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM15Q13444 863 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
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