RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 HEY1Q9Y5J3 304 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 KIF20BQ96Q89 1820 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM247A6NEH6 219 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 SCYL3Q8IZE3 742 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 SMC6Q96SB8 1091 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PITPNM3Q9BZ71 974 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 MYH6P13533 1939 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PASKQ96RG2 1323 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 BTBD11A6QL63 1104 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 RAD21O60216 631 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PRDM1O75626 825 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 LONRF1Q17RB8 773 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 DSTYKQ6XUX3 929 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC65Q8IXS2 484 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TBC1D16Q8TBP0 767 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 LZICQ8WZA0 190 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 WASF1Q92558 559 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TBK1Q9UHD2 729 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ADGRB3O60242 1522 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TXNDC9O14530 226 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PDE5AO76074 875 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 KLC3Q6P597 504 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 SATL1Q86VE3 508 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 39.4
TMOD1-203ENST00000395211 GATA6Q92908 595 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 SEMA4AQ9H3S1 761 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 MYH2Q9UKX2 1941 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 WNT7AO00755 349 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PGM3O95394 542 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 KRT13P13646 458 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 CCNB1P14635 433 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PLCG2P16885 1265 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 MARK3P27448 753 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 MCM7P33993 719 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PTGDRQ13258 359 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 C6orf183Q5T699 404 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 NME8Q8N427 588 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 AZIN2Q96A70 460 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ERLEC1Q96DZ1 483 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 BTBD7Q9P203 1132 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 O00370 1275 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 SPTLC1O15269 473 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TBX10O75333 385 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 GJB6O95452 261 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 AGTP01019 485 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PPP2R5CQ13362 524 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ITGA7Q13683 1181 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 PARP6Q2NL67 630 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ADSSL1Q8N142 457 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 OLFM3Q96PB7 478 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 OAS1P00973 400 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 LMNAP02545 664 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 CDR2Q01850 454 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 BTKQ06187 659 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 WASHC2DQ5SRD0 308 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 KBTBD2Q8IY47 623 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 VPS52Q8N1B4 723 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 GLG1Q92896 1179 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 TTC1Q99614 292 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 MYD88Q99836 296 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 NAPBQ9H115 298 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 LGR6Q9HBX8 967 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD1-203ENST00000395211 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 196.8 ms