RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 SQORQ9Y6N5 450 aa22.32■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 GPR32O75388 356 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 CYP4A11Q02928 519 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TTC38Q5R3I4 469 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 USP38Q8NB14 1042 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 LXNQ9BS40 222 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 PADI3Q9ULW8 664 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 EVPLQ92817 2033 aa22.31■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 NPEPPSP55786 919 aa22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TAP1Q03518 808 aa22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 DRP2Q13474 957 aa22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 SPRED2Q7Z698 418 aa22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TOP1MTQ969P6 601 aa22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 RAD9AQ99638 391 aa22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 OSMRQ99650 979 aa22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 AKT3Q9Y243 479 aa22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 POTEMA6NI47 508 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ENPP3O14638 875 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ZBTB39O15060 712 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 SLITRK3O94933 977 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 UPP2O95045 317 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TMOD1P28289 359 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TRAPPC10P48553 1259 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 PAK2Q13177 524 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 CUL4AQ13619 759 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 C4orf19Q8IY42 314 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 MAP7D2Q96T17 732 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TMX1Q9H3N1 280 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 OR52Z1P0C646 297 aa22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 MCTP1Q6DN14 999 aa22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 TPH2Q8IWU9 490 aa22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 CERS4Q9HA82 394 aa22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 PPM1EQ8WY54 764 aa22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 CEP170P1Q96L14 293 aa22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.27■■□□□ 1.16
PARL-201ENST00000311101 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 EPOPA6NHQ4 379 aa22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 RPS6KA5O75582 802 aa22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 TECP42680 631 aa22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 GPC3P51654 580 aa22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 ADGRE1Q14246 886 aa22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 FAM228AQ86W67 206 aa22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 INSL6Q9Y581 213 aa22.26■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 REV3LO60673 3130 aa22.25■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 H3BQV1 296 aa22.25■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 RFXAPO00287 272 aa22.25■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 MGEA5O60502 916 aa22.25■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.25■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.25■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 TRANK1O15050 2925 aa22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 LINC01553A4QN01 128 aa22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 LYPLA2O95372 231 aa22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 IGFBP4P22692 258 aa22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 NEK9Q8TD19 979 aa22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 YME1L1Q96TA2 773 aa22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 A0A087WWV3 80 aa22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 GPR182O15218 404 aa22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 DNM2P50570 870 aa22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 XKR9Q5GH70 373 aa22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms