RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sh2d4bA6X942 431 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trappc10Q3TLI0 1259 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fdxacb1Q3UY23 622 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bahd1Q497V6 772 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Grik5Q61626 979 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpd2Q64521 727 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smarcal1Q8BJL0 910 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PdhxQ8BKZ9 501 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrfn3Q8BLY3 626 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pramel1Q99MW3 458 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CntrlA2AL36 2334 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Api5O35841 504 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Casp14O89094 257 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdc25aP48964 514 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pkn1P70268 946 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Erbb2P70424 1256 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ItgaeQ60677 1167 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kpna1Q60960 538 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arpp21Q9DCB4 807 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm45015A0A140LII9 184 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm18336A0A140LIU8 765 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlgn4lB0F2B4 945 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp26c1B2RXA7 518 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm10436L7N1Y3 520 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Entpd2O55026 495 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pde6bP23440 856 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ogfod1Q3U0K8 545 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam198aQ3UY90 562 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 4933427I04RikQ3V053 235 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Meis1Q60954 390 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mcf2lQ64096 1149 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Krt87Q6IMF0 495 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Celf4Q7TSY6 486 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zmynd15Q8C0R7 736 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ago4Q8CJF8 861 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kremen2Q8K1S7 461 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Appl2Q8K3G9 662 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tspyl4Q8VD63 406 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Drc3Q9D5E4 523 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Extl2Q9ES89 330 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plxna3P70208 1872 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp292Q9Z2U2 2698 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc78D3Z5T1 437 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TdgP56581 421 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sparcl1P70663 650 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 VcpQ01853 806 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prkag3Q8BGM7 489 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8BHR8 331 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp317Q8C0Q5 607 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tfr2Q9JKX3 798 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Grb14Q9JLM9 538 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adamts20P59511 1906 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 A0A0U1RNP2 1173 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SarsP26638 512 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmprss9P69525 1065 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PogkQ80TC5 607 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 P2ry10Q8BFU7 328 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Asb2Q8K0L0 634 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plcb4Q91UZ1 1175 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 VasnQ9CZT5 673 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Armc9Q9D2I5 817 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mipol1Q9D9F8 279 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map7d1A2AJI0 846 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zscan4fQ3URS2 506 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cpa2Q504N0 417 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem132dQ76HP3 1097 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam129bQ8R1F1 749 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp2r5dQ91V89 594 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prmt7Q922X9 692 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Krt34Q9D646 392 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbp7Q9EPC5 134 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tlr6Q9EPW9 795 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mgea5Q9EQQ9 916 aa24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ampd3O08739 766 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mpp3O88910 568 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mfsd14aP70187 490 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ces1eQ64176 562 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CrygnQ8VHL5 183 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnh7Q9ER47 1195 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PigoQ9JJI6 1093 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PorcnQ9JJJ7 461 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tp53bp1P70399 1969 aa24.18■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abca4O35600 2310 aa24.17■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CluhQ5SW19 1315 aa24.17■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fgf18O89101 207 aa24.17■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccl4P14097 92 aa24.17■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Actr2P61161 394 aa24.17■■□□□ 1.46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Epha2Q03145 977 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.5 ms