Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2I5

Armc9, LisH domain-containing protein ARMC9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Armc9Q9D2I5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Armc9Q9D2I5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Armc9Q9D2I5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Armc9Q9D2I5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Armc9Q9D2I5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Armc9Q9D2I5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Armc9Q9D2I5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Armc9Q9D2I5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Armc9Q9D2I5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Armc9Q9D2I5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Armc9Q9D2I5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Armc9Q9D2I5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Armc9Q9D2I5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Armc9Q9D2I5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Armc9Q9D2I5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Armc9Q9D2I5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Armc9Q9D2I5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Armc9Q9D2I5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Armc9Q9D2I5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Armc9Q9D2I5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Armc9Q9D2I5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Armc9Q9D2I5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Armc9Q9D2I5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Armc9Q9D2I5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Armc9Q9D2I5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Armc9Q9D2I5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Armc9Q9D2I5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Armc9Q9D2I5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Armc9Q9D2I5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Armc9Q9D2I5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Armc9Q9D2I5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Armc9Q9D2I5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Armc9Q9D2I5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Armc9Q9D2I5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Armc9Q9D2I5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Armc9Q9D2I5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Armc9Q9D2I5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Armc9Q9D2I5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Armc9Q9D2I5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Armc9Q9D2I5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Armc9Q9D2I5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Armc9Q9D2I5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Armc9Q9D2I5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Armc9Q9D2I5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Armc9Q9D2I5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Armc9Q9D2I5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Armc9Q9D2I5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Armc9Q9D2I5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Armc9Q9D2I5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Armc9Q9D2I5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Armc9Q9D2I5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Armc9Q9D2I5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Armc9Q9D2I5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Armc9Q9D2I5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Armc9Q9D2I5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Armc9Q9D2I5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Armc9Q9D2I5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Armc9Q9D2I5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Armc9Q9D2I5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Armc9Q9D2I5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Armc9Q9D2I5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Armc9Q9D2I5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Armc9Q9D2I5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Armc9Q9D2I5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Armc9Q9D2I5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Armc9Q9D2I5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Armc9Q9D2I5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Armc9Q9D2I5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Armc9Q9D2I5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Armc9Q9D2I5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Armc9Q9D2I5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Armc9Q9D2I5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Armc9Q9D2I5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Armc9Q9D2I5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Armc9Q9D2I5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Armc9Q9D2I5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Armc9Q9D2I5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Armc9Q9D2I5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Armc9Q9D2I5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Armc9Q9D2I5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Armc9Q9D2I5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Armc9Q9D2I5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Armc9Q9D2I5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Armc9Q9D2I5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Armc9Q9D2I5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Armc9Q9D2I5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Armc9Q9D2I5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Armc9Q9D2I5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Armc9Q9D2I5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Armc9Q9D2I5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Armc9Q9D2I5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Armc9Q9D2I5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Armc9Q9D2I5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Armc9Q9D2I5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Armc9Q9D2I5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Armc9Q9D2I5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Armc9Q9D2I5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Armc9Q9D2I5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Armc9Q9D2I5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Armc9Q9D2I5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms