Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHL5

Crygn, Gamma-crystallin N, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygnQ8VHL5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
CrygnQ8VHL5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CrygnQ8VHL5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CrygnQ8VHL5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CrygnQ8VHL5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CrygnQ8VHL5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CrygnQ8VHL5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CrygnQ8VHL5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CrygnQ8VHL5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CrygnQ8VHL5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CrygnQ8VHL5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CrygnQ8VHL5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CrygnQ8VHL5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CrygnQ8VHL5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CrygnQ8VHL5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CrygnQ8VHL5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CrygnQ8VHL5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CrygnQ8VHL5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CrygnQ8VHL5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CrygnQ8VHL5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CrygnQ8VHL5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CrygnQ8VHL5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CrygnQ8VHL5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CrygnQ8VHL5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CrygnQ8VHL5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CrygnQ8VHL5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CrygnQ8VHL5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CrygnQ8VHL5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CrygnQ8VHL5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CrygnQ8VHL5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CrygnQ8VHL5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CrygnQ8VHL5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CrygnQ8VHL5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CrygnQ8VHL5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CrygnQ8VHL5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CrygnQ8VHL5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CrygnQ8VHL5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CrygnQ8VHL5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CrygnQ8VHL5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CrygnQ8VHL5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CrygnQ8VHL5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CrygnQ8VHL5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CrygnQ8VHL5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CrygnQ8VHL5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CrygnQ8VHL5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CrygnQ8VHL5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CrygnQ8VHL5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CrygnQ8VHL5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CrygnQ8VHL5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CrygnQ8VHL5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CrygnQ8VHL5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CrygnQ8VHL5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CrygnQ8VHL5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CrygnQ8VHL5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CrygnQ8VHL5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CrygnQ8VHL5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CrygnQ8VHL5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CrygnQ8VHL5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CrygnQ8VHL5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CrygnQ8VHL5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CrygnQ8VHL5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CrygnQ8VHL5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CrygnQ8VHL5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CrygnQ8VHL5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CrygnQ8VHL5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CrygnQ8VHL5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CrygnQ8VHL5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CrygnQ8VHL5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CrygnQ8VHL5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CrygnQ8VHL5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CrygnQ8VHL5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CrygnQ8VHL5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CrygnQ8VHL5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CrygnQ8VHL5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CrygnQ8VHL5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CrygnQ8VHL5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CrygnQ8VHL5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CrygnQ8VHL5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CrygnQ8VHL5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CrygnQ8VHL5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CrygnQ8VHL5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CrygnQ8VHL5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CrygnQ8VHL5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CrygnQ8VHL5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CrygnQ8VHL5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CrygnQ8VHL5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CrygnQ8VHL5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CrygnQ8VHL5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CrygnQ8VHL5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CrygnQ8VHL5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CrygnQ8VHL5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CrygnQ8VHL5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CrygnQ8VHL5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CrygnQ8VHL5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CrygnQ8VHL5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CrygnQ8VHL5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CrygnQ8VHL5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CrygnQ8VHL5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CrygnQ8VHL5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CrygnQ8VHL5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms