RNA–Protein interactions for RNA: YFR052C-A

YFR052C-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR052C-A, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR052C-AYFR052C-A UTP30P36144 274 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A CKB2P38930 258 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A ERG28P40030 148 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A SWP82P43554 623 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A YJL118WP47022 219 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A YGR079WP53249 370 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A MAL13P53338 473 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A ATG4P53867 494 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data5.09□□□□□ -1.59not detected
YFR052C-AYFR052C-A YPL014WQ02606 381 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A LGE1Q02796 332 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A HLR1Q04429 423 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A YPR078CQ06813 372 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A OSW1Q08692 278 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A TMA46Q12000 345 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A RCN2Q12044 265 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A ELG1Q12050 791 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A DAP1Q12091 152 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A KCS1Q12494 1050 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A YBR298C-AQ8TGK4 73 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A RGS2Q99188 309 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR052C-AYFR052C-A CDC7P06243 507 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SEC53P07283 254 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A IMA3P0CW40 589 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A IMA4P0CW41 589 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A MRP13P12686 339 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A CUP2P15315 225 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SAC7P17121 654 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A MET16P18408 261 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SEC59P20048 519 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A PRE1P22141 198 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A MEK1P24719 497 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A CDC50P25656 391 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A CAP1P28495 268 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A PEX4P29340 183 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A AFG1P32317 509 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A ISF1P32488 338 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A TRM2P33753 639 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A RIB1P38066 345 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A THI2P38141 450 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A ZTA1P38230 334 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A VHC1P38329 1120 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YER130CP39959 443 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SER2P42941 309 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A RGD2P43556 714 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SFH5P47008 294 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A IMA1P53051 589 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YGL114WP53134 725 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A GND2P53319 492 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YNL140CP53910 189 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YCL001W-AP87012 153 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A CDC55Q00362 526 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YDR391CQ04170 232 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YML096WQ04489 525 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A TMA10Q06177 86 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A FRA1Q07825 749 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A HRD1Q08109 551 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A IMA2Q08295 589 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YPR027CQ12079 277 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A TMS1Q12116 473 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A NMD4Q12129 218 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YOR114WQ12219 294 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YOR029WQ12243 111 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YIR021W-AQ3E739 70 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A ATP2P00830 511 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A AI1P03875 834 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A RPL24AP04449 155 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A PUT1P09368 476 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A STE18P18852 110 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SPO11P23179 398 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A PRE9P23638 258 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A EXG1P23776 448 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A GSY2P27472 705 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data5.07□□□□□ -1.6not detected
YFR052C-AYFR052C-A SRB5P32585 307 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SKT5P34226 696 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A RRN10P38204 145 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A TCM62P38228 572 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A YPT31P38555 223 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SMF1P38925 575 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A UME6P39001 836 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A DHH1P39517 506 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A NPP2P39997 493 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A LCP5P40079 357 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A PSF2P40359 213 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A PFK26P40433 827 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A SEC24P40482 926 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A PMT6P42934 759 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A GZF3P42944 551 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A GSM1P42950 618 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A GUF1P46943 645 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A ERV14P53173 138 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A NOG2P53742 486 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A BOR1P53838 576 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A ASI2P53895 289 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A ACT1P60010 375 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YFR052C-AYFR052C-A ATP25Q03153 612 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.3 ms