RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 STXBP3O00186 592 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAM10O14672 748 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM24O15164 1050 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSFA2P28290 1259 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNFP41002 786 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 MPP3Q13368 585 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT73Q86Y46 540 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTLL11Q8NHH1 800 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF414Q96IQ9 312 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 CITED4Q96RK1 184 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 BHMT2Q9H2M3 363 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM260Q9NX78 707 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 TLR6Q9Y2C9 796 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF839A8K0R7 811 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 HGSO14964 777 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFB5O43674 189 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRKCGP05129 697 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALPLP05186 524 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP17L7P0C7H9 530 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 STAT3P40763 770 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRE11P49959 708 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST5P78524 1137 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PFKPQ01813 784 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAPQ12770 1279 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 INF2Q27J81 1249 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 LEXMQ3ZCV2 418 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD39Q53RE8 183 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH2D6Q7Z4S9 175 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDLIM2Q96JY6 352 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAM2Q99965 735 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC46A2Q9BY10 475 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB6Q9NWX5 421 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 GMIPQ9P107 970 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 AOX1Q06278 1338 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PRX2 142 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ICMTO60725 284 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 F13A1P00488 732 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGCRP04035 888 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAMP19021 973 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 KELP23276 732 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTR6P50406 440 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K11Q16584 847 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 BEAN1Q3B7T3 259 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD276Q5ZPR3 534 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCAF15Q66K64 600 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPFIBP1Q86W92 1011 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 MDGA1Q8NFP4 955 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 DBF4BQ8NFT6 615 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 GATAD2BQ8WXI9 593 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 RABGGTAQ92696 567 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 NKD1Q969G9 470 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARMC5Q96C12 935 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATG4CQ96DT6 458 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYZL4Q96KX0 146 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZDHHC15Q96MV8 337 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SETDB2Q96T68 719 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXL7Q9UJT9 491 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 BACE2Q9Y5Z0 518 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 C4orf47A7E2U8 309 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 LATS1O95835 1130 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CKBP12277 381 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNQ1P51787 676 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 JAM2P57087 298 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 TP53BP2Q13625 1128 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACAP1Q15027 740 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABHD17BQ5VST6 288 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 STEAP3Q658P3 488 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CUZD1Q86UP6 607 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC44A3Q8N4M1 653 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 MB21D1Q8N884 522 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 DENND1AQ8TEH3 1009 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMCESQ96FZ2 354 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPHA2Q96T91 129 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 MMP19Q99542 508 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNH6Q9H252 994 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL17RBQ9NRM6 502 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 GJB4Q9NTQ9 266 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYOTQ9UBF9 498 aa0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms