RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 MAF1Q9H063 256 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CREBZFQ9NS37 354 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CSADQ9Y600 493 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 SFI1A8K8P3 1242 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 LYPLA2O95372 231 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP25P42331 645 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 NFIL3Q16649 462 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 MAP7D2Q96T17 732 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 POLD4Q9HCU8 107 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.02□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 KRT83P78385 493 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K9P80192 1104 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 VGLL4Q14135 290 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 NEK11Q8NG66 645 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 BAP1Q92560 729 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 MAFGO15525 162 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 TGFB1I1O43294 461 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ATP9AO75110 1047 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ABL1P00519 1130 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 NR3C1P04150 777 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 HSPA6P17066 643 aa9.02□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SFNP31947 248 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 HERVK_113P62684 666 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 HTRA3P83110 453 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 KCNA1Q09470 495 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 MAPK7Q13164 816 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 PADI6Q6TGC4 694 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 GPRASP2Q96D09 838 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 CEP72Q9P209 647 aa9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SAMM50Q9Y512 469 aa9.02□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 NOL4O94818 638 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 NR3C2P08235 984 aa9.01□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 JAK3P52333 1124 aa9.01□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.01□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 C4orf19Q8IY42 314 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 DAW1Q8N136 415 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 RDM1Q8NG50 284 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 STRA6Q9BX79 667 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ACAD9Q9H845 621 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ELP3Q9H9T3 547 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 UNCXA6NJT0 531 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 WDR64B1ANS9 1081 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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