RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 CAMK1Q14012 370 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 COL19A1Q14993 1142 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 IGFLR1Q9H665 355 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 SQORQ9Y6N5 450 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
PRAME-212ENST00000485532 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ESYT2A0FGR8 921 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 EDIL3O43854 480 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 VTNP04004 478 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 RPS6KB1P23443 525 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 SLC26A2P50443 739 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 NTRK3Q16288 839 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 PRR16Q569H4 304 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 GJD3Q8N144 294 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 NME8Q8N427 588 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 C6orf50Q9HD87 102 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 HCSTQ9UBK5 93 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 NID2Q14112 1375 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 C22orf31O95567 290 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 MMP1P03956 469 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ITGB1P05556 798 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 IRS1P35568 1242 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 KIZQ2M2Z5 673 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 GJA10Q969M2 543 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 LENG9Q96B70 501 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 COL1A2P08123 1366 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TBX10O75333 385 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 RPS6KA5O75582 802 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 STAG3L1P0CL83 205 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 CLCN3P51790 818 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 METTL13Q8N6R0 699 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 OSMRQ99650 979 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ADAM2Q99965 735 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TRIOO75962 3097 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 GPR32O75388 356 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 CIITAP33076 1130 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ZP2Q05996 745 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 FAM228AQ86W67 206 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 PLVAPQ9BX97 442 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 SAMM50Q9Y512 469 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 DENND3A2RUS2 1198 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-212ENST00000485532 C9IYK1 514 aa14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms