RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461405.1

PHF20-208, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 2

Gene PHF20, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-208	ENST00000461405	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	NPEPPS	P55786	919 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	NUCB2	P80303	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	GRB10	Q13322	594 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	HYI	Q5T013	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405		H0YGN5	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	SPTLC2	O15270	562 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	GNAT1	P11488	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CYP2C18	P33260	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	STK38	Q15208	465 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	AK8	Q96MA6	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	TCHH	Q07283	1943 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PPP6R2	O75170	966 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	TIMP1	P01033	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CKB	P12277	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MUT	P22033	750 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KLRC1	P26715	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	RARRES1	P49788	294 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CLCN3	P51790	818 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MGAT3	Q09327	533 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	DRP2	Q13474	957 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	GPNMB	Q14956	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	SCLY	Q96I15	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405		A0A087X0B3	334 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405		E9PMD0	336 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CTSH	P09668	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	RAG1	P15918	1043 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	EPHB4	P54760	987 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CCL23	P55773	120 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KRT85	P78386	507 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CABP7	Q86V35	215 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	BAD	Q92934	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	EVPL	Q92817	2033 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	CAND2	O75155	1236 aa		13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms