RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCEAL5Q5H9L2 206 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM22Q8IYM9 498 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP5P59047 1200 aa29.66■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRIPAKQ8N1N5 446 aa29.66■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LENG9Q96B70 501 aa29.66■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMX1Q9H3N1 280 aa29.66■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAMM50Q9Y512 469 aa29.66■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRM6O15303 877 aa29.65■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDHR5Q9HBB8 845 aa29.65■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABBR1Q9UBS5 961 aa29.65■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS6KA5O75582 802 aa29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C22orf31O95567 290 aa29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLVAPQ9BX97 442 aa29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-5Q9HDB9 667 aa29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRFN2Q9ULH4 789 aa29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR64B1ANS9 1081 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL9A1P20849 921 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP11P51784 963 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ODR4Q5SWX8 454 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL13Q8N6R0 699 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM6SF1Q9BZW5 370 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EVPLQ92817 2033 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPLX1O14810 134 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSH4O15457 936 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EP400NLQ6ZTU2 488 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEK9Q8TD19 979 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM40Q8WWA1 233 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM167AQ96KS9 214 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BQ06 376 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDIL3O43854 480 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SARSP49591 514 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL19A1Q14993 1142 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIZQ2M2Z5 673 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R16BQ96T49 567 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIT2Q99578 217 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DISC1Q9NRI5 854 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DENND3A2RUS2 1198 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR182O15218 404 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCK2O43639 380 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAS7O60861 476 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEXIO95424 95 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBCKQ8TEA7 893 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RX5Q93086 422 aa29.6■■■□□ 2.33
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO7AQ13402 2215 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEB2O15479 319 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGEA5O60502 916 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP1P03956 469 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VTNP04004 478 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAALADL2Q58DX5 795 aa29.59■■■□□ 2.33
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC5A5Q92911 643 aa29.59■■■□□ 2.33
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM2Q99965 735 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS18Q9NS28 235 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDND1Q9NY35 253 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLAGL2Q9UPG8 496 aa29.59■■■□□ 2.33
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL9P15248 144 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GATMP50440 423 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK3Q13188 491 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRCH2Q5VUJ6 765 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM178BQ8IXR5 827 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEKT3Q9BXF9 490 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPHX3Q9H6B9 360 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRBP2Q9NSY0 501 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1671Q9BY89 1806 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMP2AO43633 222 aa29.57■■■□□ 2.32
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