RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR150Q8NGU9 434 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 LPPQ93052 612 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 WNK4Q96J92 1243 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 IER2Q9BTL4 223 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 BTBD2Q9BX70 525 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 RIC8BQ9NVN3 520 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 B2RBV5 119 aa3.55□□□□□ -1.84
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RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 AOAHP28039 575 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCNN1GP51170 649 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR85P60893 370 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTPAQ15257 358 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q6ZRM9 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 EEPD1Q7L9B9 569 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 IFNL3Q8IZI9 196 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 RABGGTAQ92696 567 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 ALG1Q9BT22 464 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 DDAH1O94760 285 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 ABHD16AO95870 558 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAPNS1P04632 268 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 FIGNQ5HY92 759 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 COLEC12Q5KU26 742 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRAMD4Q6IC98 578 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 DPH6Q7L8W6 267 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF276Q8N554 614 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR87Q9BY21 358 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR10A5Q9H207 317 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 DLX3O60479 287 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 ITGB1P05556 798 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRIA2P42262 883 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 HERVK_113P62684 666 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 CD83Q01151 205 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 FXNQ16595 210 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC10A6Q3KNW5 377 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 RABL3Q5HYI8 236 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 KANK2Q63ZY3 851 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 EP400NLQ6ZTU2 488 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 SH3RF2Q8TEC5 729 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 TOR3AQ9H497 397 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 IPPKQ9H8X2 491 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 FZD1Q9UP38 647 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 VWA7Q9Y334 891 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.52□□□□□ -1.85
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RNU2-38P-201ENST00000410856 B3GALT2O43825 422 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM20BO75063 409 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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RNU2-38P-201ENST00000410856 ECE1P42892 770 aa3.52□□□□□ -1.85
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RNU2-38P-201ENST00000410856 MAP3K12Q12852 859 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 MOGSQ13724 837 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR19Q15760 415 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 STYK1Q6J9G0 422 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 GAREM2Q75VX8 874 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 VRK3Q8IV63 474 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRID2IPA4D2P6 1211 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 PROB1E7EW31 1015 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNT2Q6UVM3 1135 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 NELL1Q92832 810 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 MLST8Q9BVC4 326 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 BTBD7Q9P203 1132 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 COX11Q9Y6N1 276 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A1W2PQU0 124 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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