RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 SH2D3AQ9BRG2 576 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 NUP62CLQ9H1M0 184 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 CLSTN2Q9H4D0 955 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 HBP1O60381 514 aa32.98■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 E2F4Q16254 413 aa32.98■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 OTUD6AQ7L8S5 288 aa32.98■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 IQUBQ8NA54 791 aa32.98■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 ANKLE1Q8NAG6 615 aa32.98■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa32.98■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF20Q3BBV1 942 aa32.97■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 ANKEF1Q9NU02 776 aa32.97■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 STK17AQ9UEE5 414 aa32.97■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 KAT6AQ92794 2004 aa32.97■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 BHMT2Q9H2M3 363 aa32.96■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 KINO60870 393 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 EYA4O95677 639 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 INSRRP14616 1297 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 CAPN2P17655 700 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 NPEPPSP55786 919 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 MTERF2Q49AM1 385 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 XKR9Q5GH70 373 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 RAD54LQ92698 747 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 STARD7Q9NQZ5 370 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 GRIN2DO15399 1336 aa32.95■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 RARRES1P49788 294 aa32.95■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 C7orf31Q8N865 590 aa32.95■■■□□ 2.86
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ECHS1-201ENST00000368547 CEP170P1Q96L14 293 aa32.95■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.86
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF202O95125 648 aa32.94■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 PPFIA1Q13136 1202 aa32.94■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 ITGA7Q13683 1181 aa32.94■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 TIGD1Q96MW7 591 aa32.94■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 HDAC6Q9UBN7 1215 aa32.94■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SYCE3A1L190 88 aa32.93■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB42B2RXF5 422 aa32.93■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2G4BP0C869 781 aa32.93■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 MCM6Q14566 821 aa32.93■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
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ECHS1-201ENST00000368547 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa32.93■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SERTAD1Q9UHV2 236 aa32.93■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP32.92■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 EN2P19622 333 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
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ECHS1-201ENST00000368547 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 GRIK4Q16099 956 aa32.92■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF484Q5JVG2 852 aa32.92■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 LRSAM1Q6UWE0 723 aa32.92■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 TNMDQ9H2S6 317 aa32.92■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 CUEDC2Q9H467 287 aa32.92■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SETD4Q9NVD3 440 aa32.92■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF35A5YM69 484 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 FAM47CQ5HY64 1035 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 NRCAMQ92823 1304 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 COL1A2P08123 1366 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SLC12A3P55017 1021 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 NFRKBQ6P4R8 1299 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 CEP57L1Q8IYX8 460 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 LMBR1Q8WVP7 490 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 CEP89Q96ST8 783 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 USP25Q9UHP3 1055 aa32.91■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SLFN14P0C7P3 912 aa32.9■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 COL6A1P12109 1028 aa32.9■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 HIC1Q14526 733 aa32.89■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 PADI6Q6TGC4 694 aa32.89■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 SV2BQ7L1I2 683 aa32.89■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa32.89■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
ECHS1-201ENST00000368547 RRN3P2A6NIE6 340 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 KRBA2Q6ZNG9 492 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 SESTD1Q86VW0 696 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 CNNM3Q8NE01 707 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 STAMQ92783 540 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 FSD2A1L4K1 749 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 C17orf102A2RUQ5 167 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 HOXC8P31273 242 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 MARCH8Q5T0T0 291 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 TNS4Q8IZW8 715 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 SLC43A3Q8NBI5 491 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB10Q96DT7 871 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf49Q9H6J7 331 aa32.88■■■□□ 2.85
ECHS1-201ENST00000368547 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
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