RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022356.11

Usp54-201, Transcript of Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Usp54, Length 6,580 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm14819Q62478 212 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fastkd1Q6DI86 829 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Krt77Q6IFZ6 572 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ccdc25Q78PG9 208 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Abhd12bG3UZN6 359 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Btg4O70552 250 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gpr101Q80T62 511 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ms4a5Q810P8 197 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 MtrrQ8C1A3 696 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cabs1Q8C633 391 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Abcb5B5X0E4 1255 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dnajb6O54946 365 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 CopeO89079 308 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Clcn1Q64347 994 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ublcp1Q8BGR9 318 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pnma2Q8BHK0 365 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 MrgbpQ9DAT2 204 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tssc4Q9JHE7 317 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 RptorQ8K4Q0 1335 aa8.66□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ripor3A1L3T7 938 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Slc16a6B1AT66 607 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rasa1E9PYG6 1038 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lrrc32G3XA59 663 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Zfp850J3QPC5 689 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Soat2O88908 525 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 PolP11369 1281 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 VclQ64727 1066 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pcsk9Q80W65 694 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Them6Q80ZW2 207 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ppp1r16aQ923M0 524 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 CutaQ9CQ89 177 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rtl9Q32KG4 1339 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Syndig1A2ANU3 258 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rhox3cA2AWM0 215 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rhox3hL7MU37 215 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Sh3bp1P55194 680 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ece1Q4PZA2 769 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rhox3aQ4TU90 215 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Aggf1Q7TN31 711 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lca5Q80ST9 704 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tlr3Q99MB1 905 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Mlh1Q9JK91 760 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ifi202Q9R002 445 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Col15a1O35206 1367 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm6121L7MUF1 212 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 UncxO08934 530 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lsp1P19973 330 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Hsd17b4P51660 735 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Irf5P56477 497 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Etv6P97360 485 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 CkbQ04447 381 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Nr2c1Q505F1 590 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ift20Q61025 132 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Baiap3Q80TT2 1134 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Slitrk1Q810C1 696 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ttc27Q8CD92 847 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Polr3fQ921X6 316 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ggt7Q99JP7 662 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Anapc7Q9WVM3 565 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Zkscan16A2ALW2 728 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Map10Q8BJS7 891 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pus7lQ8CE46 702 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rcan3Q9JKK0 239 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Stat2Q9WVL2 923 aa8.65□□□□□ -1.02
Usp54-201ENSMUST00000022356 Nwd1A6H603 1563 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm5483B2RV77 97 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ncf2O70145 525 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Map4k1P70218 827 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lrfn2Q80TG9 788 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tor4aQ8BH02 426 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gpc3Q8CFZ4 579 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rnf208Q8K0W3 265 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Alpk1Q9CXB8 1231 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Phf14Q9D4H9 881 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Paip2Q9D6V8 124 aa8.65□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lcn6A2AJB9 181 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Skint6A7XUZ6 1240 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dcdc2bF7BCK0 340 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Alppl2P24823 529 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ptgs2Q05769 604 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cyp11b1Q3TG86 501 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 PighQ5M9N4 188 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pomgnt2Q8BW41 605 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Stx19Q8R1Q0 292 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Trex1Q91XB0 314 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Bmp2kQ91Z96 1138 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 PccaQ91ZA3 724 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Usp11Q99K46 921 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cfap73J3QPZ5 306 aa8.64□□□□□ -1.03
Usp54-201ENSMUST00000022356 Vmn2r1O70410 912 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.2 ms