Protein–RNA interactions for Protein: Q9R002

Ifi202, Interferon-activable protein 202, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi202Q9R002 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
Ifi202Q9R002 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ifi202Q9R002 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ifi202Q9R002 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ifi202Q9R002 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Ifi202Q9R002 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Ifi202Q9R002 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ifi202Q9R002 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Ifi202Q9R002 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ifi202Q9R002 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ifi202Q9R002 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ifi202Q9R002 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ifi202Q9R002 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Ifi202Q9R002 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ifi202Q9R002 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ifi202Q9R002 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ifi202Q9R002 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ifi202Q9R002 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ifi202Q9R002 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ifi202Q9R002 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ifi202Q9R002 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Ifi202Q9R002 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.26
Ifi202Q9R002 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ifi202Q9R002 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ifi202Q9R002 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ifi202Q9R002 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ifi202Q9R002 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Ifi202Q9R002 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Ifi202Q9R002 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ifi202Q9R002 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ifi202Q9R002 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ifi202Q9R002 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ifi202Q9R002 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ifi202Q9R002 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ifi202Q9R002 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ifi202Q9R002 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ifi202Q9R002 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ifi202Q9R002 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ifi202Q9R002 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ifi202Q9R002 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ifi202Q9R002 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ifi202Q9R002 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ifi202Q9R002 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ifi202Q9R002 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ifi202Q9R002 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Ifi202Q9R002 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ifi202Q9R002 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ifi202Q9R002 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ifi202Q9R002 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ifi202Q9R002 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ifi202Q9R002 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ifi202Q9R002 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ifi202Q9R002 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ifi202Q9R002 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ifi202Q9R002 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ifi202Q9R002 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ifi202Q9R002 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ifi202Q9R002 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ifi202Q9R002 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ifi202Q9R002 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ifi202Q9R002 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ifi202Q9R002 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ifi202Q9R002 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ifi202Q9R002 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ifi202Q9R002 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ifi202Q9R002 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ifi202Q9R002 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ifi202Q9R002 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ifi202Q9R002 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ifi202Q9R002 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ifi202Q9R002 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ifi202Q9R002 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ifi202Q9R002 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ifi202Q9R002 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ifi202Q9R002 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ifi202Q9R002 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ifi202Q9R002 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ifi202Q9R002 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ifi202Q9R002 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Ifi202Q9R002 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ifi202Q9R002 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ifi202Q9R002 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Ifi202Q9R002 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ifi202Q9R002 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ifi202Q9R002 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ifi202Q9R002 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ifi202Q9R002 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ifi202Q9R002 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ifi202Q9R002 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ifi202Q9R002 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ifi202Q9R002 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ifi202Q9R002 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ifi202Q9R002 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ifi202Q9R002 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ifi202Q9R002 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ifi202Q9R002 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ifi202Q9R002 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ifi202Q9R002 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ifi202Q9R002 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ifi202Q9R002 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms