Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVP9

Ptk2b, Protein-tyrosine kinase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2bQ9QVP9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Ptk2bQ9QVP9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ptk2bQ9QVP9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ptk2bQ9QVP9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ptk2bQ9QVP9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ptk2bQ9QVP9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Ptk2bQ9QVP9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ptk2bQ9QVP9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Ptk2bQ9QVP9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ptk2bQ9QVP9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ptk2bQ9QVP9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ptk2bQ9QVP9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ptk2bQ9QVP9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ptk2bQ9QVP9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ptk2bQ9QVP9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ptk2bQ9QVP9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Ptk2bQ9QVP9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ptk2bQ9QVP9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ptk2bQ9QVP9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ptk2bQ9QVP9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ptk2bQ9QVP9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ptk2bQ9QVP9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ptk2bQ9QVP9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ptk2bQ9QVP9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Ptk2bQ9QVP9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ptk2bQ9QVP9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ptk2bQ9QVP9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ptk2bQ9QVP9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ptk2bQ9QVP9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ptk2bQ9QVP9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ptk2bQ9QVP9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ptk2bQ9QVP9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ptk2bQ9QVP9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ptk2bQ9QVP9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ptk2bQ9QVP9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ptk2bQ9QVP9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ptk2bQ9QVP9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ptk2bQ9QVP9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ptk2bQ9QVP9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ptk2bQ9QVP9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ptk2bQ9QVP9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ptk2bQ9QVP9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ptk2bQ9QVP9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ptk2bQ9QVP9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ptk2bQ9QVP9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ptk2bQ9QVP9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ptk2bQ9QVP9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ptk2bQ9QVP9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ptk2bQ9QVP9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ptk2bQ9QVP9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ptk2bQ9QVP9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ptk2bQ9QVP9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ptk2bQ9QVP9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ptk2bQ9QVP9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ptk2bQ9QVP9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ptk2bQ9QVP9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ptk2bQ9QVP9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ptk2bQ9QVP9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ptk2bQ9QVP9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ptk2bQ9QVP9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ptk2bQ9QVP9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ptk2bQ9QVP9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ptk2bQ9QVP9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ptk2bQ9QVP9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ptk2bQ9QVP9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ptk2bQ9QVP9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ptk2bQ9QVP9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ptk2bQ9QVP9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ptk2bQ9QVP9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ptk2bQ9QVP9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ptk2bQ9QVP9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptk2bQ9QVP9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptk2bQ9QVP9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptk2bQ9QVP9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptk2bQ9QVP9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ptk2bQ9QVP9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptk2bQ9QVP9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ptk2bQ9QVP9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptk2bQ9QVP9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptk2bQ9QVP9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptk2bQ9QVP9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptk2bQ9QVP9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptk2bQ9QVP9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptk2bQ9QVP9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptk2bQ9QVP9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptk2bQ9QVP9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptk2bQ9QVP9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptk2bQ9QVP9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptk2bQ9QVP9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptk2bQ9QVP9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptk2bQ9QVP9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptk2bQ9QVP9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptk2bQ9QVP9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptk2bQ9QVP9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptk2bQ9QVP9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptk2bQ9QVP9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptk2bQ9QVP9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptk2bQ9QVP9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptk2bQ9QVP9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptk2bQ9QVP9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms