RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 TNNI1P19237 187 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 GCLMP48507 274 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PDIA5Q14554 519 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 NPY5RQ15761 445 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PLVAPQ9BX97 442 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 hCG_1984214I3L0E3 225 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 SMTNP53814 917 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 MYL7Q01449 175 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR59Q6PJI9 974 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 UBL4BQ8N7F7 174 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 AMACRQ9UHK6 382 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMC6P62333 389 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2W6PQ8NHA6 318 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 TNFRSF25Q93038 417 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC37A3O60309 1634 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC10BA6NIK2 292 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 KLRC4O43908 158 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFB10O96000 172 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 NPR1P16066 1061 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD42Q8N9B4 389 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ERGIC2Q96RQ1 377 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 TEKT3Q9BXF9 490 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 FANCGO15287 622 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF4AO95239 1232 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ZFPM1Q8IX07 1006 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 MED24O75448 989 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ADRA2BP18089 450 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PROM2Q8N271 834 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PPM1EQ8WY54 764 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PNMA5Q96PV4 448 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PLAAQ9Y263 795 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 COPB2P35606 906 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CASP4P49662 377 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPPQ6IPU0 288 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 MTMR8Q96EF0 704 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 KCND1Q9NSA2 647 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 GUCY1A3Q02108 690 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PTK2Q05397 1052 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CATSPER3Q86XQ3 398 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 SNX24Q9Y343 169 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 KCPQ6ZWJ8 1503 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 UCHL3P15374 230 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXR1Q6PIV2 292 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNCQ9H7C4 482 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ECE2O60344 883 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 FERP16591 822 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 NR1D1P20393 614 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PEX3P56589 373 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 MASTLQ96GX5 879 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 TMOD4Q9NZQ9 345 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DENND2CQ68D51 928 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 USP37Q86T82 979 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 POMGNT1Q8WZA1 660 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CEP63Q96MT8 703 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCB11O95342 1321 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PPFIA4O75335 1185 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP11B2P19099 503 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC18A3Q16572 532 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 EMBQ6PCB8 327 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 MSANTD4Q8NCY6 345 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 NACC1Q96RE7 527 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DAPK3O43293 454 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNB1P01574 187 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 C4orf32Q8N8J7 132 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR44Q5JSH3 913 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms