RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 AMNQ9BXJ7 453 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PBRM1Q86U86 1689 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 USP14P54578 494 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CUL3Q13618 768 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC12A1Q13621 1099 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 FIS1Q9Y3D6 152 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 KRT38O76015 456 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 KIF22Q14807 665 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 HSPA4LO95757 839 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PMS2P54278 862 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 SERPINB10P48595 397 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 BBS9Q3SYG4 887 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM66O15016 1216 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CHEK2O96017 543 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TTC1Q99614 292 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.271e-7■■■■□ 21.3
SH3BP2-207ENST00000503393 DCTN4Q9UJW0 460 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 M0R2C6 588 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 HAUS5O94927 633 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 POLA2Q14181 598 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ACAD11Q709F0 780 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 MED7O43513 233 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PROM2Q8N271 834 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 SAYSD1Q9NPB0 183 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 GUCY1A3Q02108 690 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CCNYQ8ND76 341 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PGBD1Q96JS3 809 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM161BQ96MY7 647 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 DNAJC6O75061 913 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 LRRC41Q15345 812 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PARVGQ9HBI0 331 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 RAP1GDS1P52306 607 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ICA1Q05084 483 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 GRM1Q13255 1194 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 19.5
SH3BP2-207ENST00000503393 ALDH1B1P30837 517 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PDE6BP35913 854 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 KCNJ6P48051 423 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ARL4CP56559 192 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 GTF2IP78347 998 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TBX22Q9Y458 520 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PPP1R37O75864 691 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 KIF19Q2TAC6 998 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 NACC1Q96RE7 527 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ANO3Q9BYT9 981 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TBCKQ8TEA7 893 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 APOA1P02647 267 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 BRAFP15056 766 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PSMD7P51665 324 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CCDC159P0C7I6 412 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ALAS1P13196 640 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ACCSQ96QU6 501 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ENO4A6NNW6 628 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 H0YIN7 160 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 DLGAP5Q15398 846 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 RASSF3Q86WH2 238 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 IL17RAQ96F46 866 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 BTBD6Q96KE9 485 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CEP72Q9P209 647 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 SUN2Q9UH99 717 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TOM1O60784 492 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 GINM1Q9NU53 330 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ADORA1P30542 326 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PHKA1P46020 1223 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.275e-10■■■□□ 15.1
SH3BP2-207ENST00000503393 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 PSD3Q9NYI0 1048 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 SNX24Q9Y343 169 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 POLD1P28340 1107 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TTLL1O95922 423 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 TNFAIP1Q13829 316 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms