RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 SERINC5Q86VE9 423 aa22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 FAM167AQ96KS9 214 aa22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.24■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 CYP4A11Q02928 519 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 MFSD5Q6N075 450 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 RETREG2Q8NC44 543 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 CAGE1Q8TC20 777 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 SCLYQ96I15 445 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 DYDC2Q96IM9 177 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 LXNQ9BS40 222 aa22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 PSMC5P62195 406 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 ADAM17P78536 824 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 FPGSQ05932 587 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM199Q8N511 208 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 GDF15Q99988 308 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 RGL1Q9NZL6 768 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 COL1A2P08123 1366 aa22.22■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM150BA6NC51 233 aa22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 LAD1O00515 517 aa22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 PITPNM1O00562 1244 aa22.21■■□□□ 1.15
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HLA-B-255ENST00000498007 CKBP12277 381 aa22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 CSF2RAP15509 400 aa22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 THPOP40225 353 aa22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 SCN5AQ14524 2016 aa22.21■■□□□ 1.15
HLA-B-255ENST00000498007 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 CTSHP09668 335 aa22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 PKP1Q13835 747 aa22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 XKR3Q5GH77 459 aa22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.2■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.141e-7■□□□□ 8.2
HLA-B-255ENST00000498007 SELPP16109 830 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 RBL2Q08999 1139 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
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HLA-B-255ENST00000498007 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 TPH2Q8IWU9 490 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 NEK9Q8TD19 979 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 ARID2Q68CP9 1835 aa22.19■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 IQCF3P0C7M6 154 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 KLRC1P26715 233 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 PRPHP41219 470 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 ERMNQ8TAM6 284 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 RAB34Q9BZG1 259 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 SLITRK3O94933 977 aa22.17■■□□□ 1.14
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HLA-B-255ENST00000498007 C22orf31O95567 290 aa22.17■■□□□ 1.14
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HLA-B-255ENST00000498007 IL17AQ16552 155 aa22.17■■□□□ 1.14
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HLA-B-255ENST00000498007 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 CLIC4Q9Y696 253 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 SIP14410 1827 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 BMP15O95972 392 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 F13A1P00488 732 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 ACRP10323 421 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 RSPH3Q86UC2 560 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 C4orf19Q8IY42 314 aa22.16■■□□□ 1.14
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