RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.39□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 SPDL1Q96EA4 605 aa13.39□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 RILPQ96NA2 401 aa13.39□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.39□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 ISLR2Q6UXK2 745 aa13.39□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 TAOK1Q7L7X3 1001 aa13.39□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.38□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 CD58P19256 250 aa13.38□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.38□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 JDP2Q8WYK2 163 aa13.38□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 SERPINB13Q9UIV8 391 aa13.38□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0G2JND7 137 aa13.38□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 ALDH3A1P30838 453 aa13.38□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 PPP2R2AP63151 447 aa13.38□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 PPP1R18Q6NYC8 613 aa13.38□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 PDXDC1Q6P996 788 aa13.38□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 WDR59Q6PJI9 974 aa13.38□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 SAAL1Q96ER3 474 aa13.38□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 SEMA3EO15041 775 aa13.37□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.37□□□□□ -0.27
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TRIOBP-211ENST00000492485 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.37□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 TRIM7Q9C029 511 aa13.37□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 CSF1RP07333 972 aa13.37□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 HSD17B3P37058 310 aa13.37□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 SARSP49591 514 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 GALCP54803 685 aa13.37□□□□□ -0.27
TRIOBP-211ENST00000492485 IL17AQ16552 155 aa13.37□□□□□ -0.27
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