RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 MARCH6O60337 910 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 HBP1O60381 514 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 RSPH10BP0C881 870 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 RDM1Q8NG50 284 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 FAM20AQ96MK3 541 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 COL1A2P08123 1366 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-208ENST00000481121 NBNO60934 754 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 GPR153Q6NV75 609 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 ARID2Q68CP9 1835 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 ATP4AP20648 1035 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 MBTPS1Q14703 1052 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 GPNMBQ14956 572 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 RSPH3Q86UC2 560 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 FAM167AQ96KS9 214 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 NEMFO60524 1076 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 CXCL10P02778 98 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 RPAINQ86UA6 219 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 VAV3Q9UKW4 847 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 GJB2P29033 226 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 PRKCEQ02156 737 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 PPP2R5CQ13362 524 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 UGCGQ16739 394 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 HAS1Q92839 578 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 WNT7AO00755 349 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 BAIAP3O94812 1187 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 OATP04181 439 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 CALCRLQ16602 461 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 ZNF862O60290 1169 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 ATP2B1P20020 1258 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 KLRC1P26715 233 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 FAM26DQ5JW98 314 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.39■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.39■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 KIF28PB7ZC32 967 aa23.39■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.39■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 BANK1Q8NDB2 785 aa23.39■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.39■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
NELFE-208ENST00000481121 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 CDH23Q9H251 3354 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 M0QZ92 97 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 EML1O00423 815 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 DNAJB2P25686 324 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 MCM7P33993 719 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 KCNJ6P48051 423 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 MGAT3Q09327 533 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 SLC9A7Q96T83 725 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 H3BQV1 296 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 SLC34A2O95436 690 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 C22orf31O95567 290 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 CHRNA1P02708 482 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.332e-6■■■□□ 16.4
NELFE-208ENST00000481121 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 IKBKEQ14164 716 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 IER5Q5VY09 327 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 EFCAB14O75071 495 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 TRAPPC10P48553 1259 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 PSMC5P62195 406 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 CUL4AQ13619 759 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 TCTN1Q2MV58 587 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 TTC38Q5R3I4 469 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-208ENST00000481121 MCTP1Q6DN14 999 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms