RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439500.5

SPAM1-205, Transcript of sperm adhesion molecule 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPAM1, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPAM1-205	ENST00000439500	CBX7	O95931	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GSN	P06396	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	NFIC	P08651	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ENPP1	P22413	925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FAM193A	P78312	1265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TIMM44	O43615	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TLR5	O60602	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GSTM1	P09488	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	VAV1	P15498	845 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	EDNRB	P24530	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FPR2	P25090	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PREP	P48147	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MOGS	Q13724	837 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ZNF174	Q15697	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	DPF3	Q92784	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GSTA4	O15217	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SNX2	O60749	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	HTR1B	P28222	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MAP2K3	P46734	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500		Q8N3U1	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ACD	Q96AP0	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	C7orf72	A4D263	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ADAM23	O75077	832 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ALX3	O95076	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ANO4	Q32M45	955 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500		A0A087WV62	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GOLIM4	O00461	696 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PAM	P19021	973 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RRM1	P23921	792 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GRK6	P43250	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CASP5	P51878	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TUSC3	Q13454	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GGT6	Q6P531	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500		A6NCN8	305 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SPAM1-205	ENST00000439500	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SPAM1-205	ENST00000439500	FKTN	O75072	461 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SPAM1-205	ENST00000439500	BMP8B	P34820	402 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SPAM1-205	ENST00000439500	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SPAM1-205	ENST00000439500	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SPAM1-205	ENST00000439500	TNK2	Q07912	1038 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SPAM1-205	ENST00000439500	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64

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