RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411328.1

RN7SKP194-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 194, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP194, Length 351 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP194-201ENST00000411328 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 GPR20Q99678 358 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 KCNK12Q9HB15 430 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 TOMM22Q9NS69 142 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 USP24Q9UPU5 2620 aa11.16□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 M0QZ92 97 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 LAG3P18627 525 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 CA8P35219 290 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 PAK2Q13177 524 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 IER5Q5VY09 327 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 PADI3Q9ULW8 664 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 CA14Q9ULX7 337 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 SQORQ9Y6N5 450 aa11.15□□□□□ -0.62
RN7SKP194-201ENST00000411328 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 KRBA1A5PL33 1030 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 HMMRO75330 724 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 NEDD9Q14511 834 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 KANK3Q6NY19 840 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 TRIM50Q86XT4 487 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 ATRIPQ8WXE1 791 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CPVLQ9H3G5 476 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.14□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 SPTLC1O15269 473 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CCND2P30279 289 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 PPFIA1Q13136 1202 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 PGM5Q15124 567 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 METTL7BQ6UX53 244 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 HCSTQ9UBK5 93 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 TUBE1Q9UJT0 475 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 FRYLO94915 3013 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 MYH6P13533 1939 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.13□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 ORC4O43929 436 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 SNHG28P0DPA3 235 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 KCNA4P22459 653 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 GRIK4Q16099 956 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 GNPTABQ3T906 1256 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 TTC14Q96N46 770 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CWH43Q9H720 699 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 VAT1LQ9HCJ6 419 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.12□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 DENND3A2RUS2 1198 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CXCL14O95715 111 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 PDE4AP27815 886 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 PPM1AP35813 382 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 HSD17B4P51659 736 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 IGBP1P78318 339 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 SP4Q02446 784 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.11□□□□□ -0.63
RN7SKP194-201ENST00000411328 CABP7Q86V35 215 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.2 ms