RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 ZBED6P86452 979 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 GRB14Q14449 540 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 ARHGEF6Q15052 776 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 TRIM11Q96F44 468 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 MPP4Q96JB8 637 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 MMP1P03956 469 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 CTGFP29279 349 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 NPY5RQ15761 445 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 MORN1Q5T089 497 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 BLIDQ8IZY5 108 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 TRIM47Q96LD4 638 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 TSKSQ9UJT2 592 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 ADORA2AP29274 412 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 LRRC31Q6UY01 552 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SCYL1Q96KG9 808 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 GJD2Q9UKL4 321 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 H3BQV1 296 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 POTEB2H3BUK9 544 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 M0R2N6 131 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 FOXN1O15353 648 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 FESP07332 822 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SYT1P21579 422 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 FOSBP53539 338 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 GUCY1B3Q02153 619 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 WLSQ5T9L3 541 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 IFFO2Q5TF58 517 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 POTEDQ86YR6 584 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SMYD1Q8NB12 490 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 DNERQ8NFT8 737 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 USP6NLQ92738 828 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 DDX12PQ92771 950 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SH3GL1Q99961 368 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 COBLO75128 1261 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 KRT2P35908 639 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 MAP2K5Q13163 448 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 AP3B2Q13367 1082 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 FXNQ16595 210 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 UBE2SQ16763 222 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 DPP9Q86TI2 863 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 RSPH3Q86UC2 560 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 USP33Q8TEY7 942 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 KCNN1Q92952 543 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-201ENST00000351328 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms