RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.06■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 LEXMQ3ZCV2 418 aa29.05■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 AIFM3Q96NN9 605 aa29.05■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 EPHX3Q9H6B9 360 aa29.05■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa29.04■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 H3BNC9 293 aa29.04■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 CHRNA1P02708 482 aa29.04■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 CIITAP33076 1130 aa29.04■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 ST3GAL1Q11201 340 aa29.04■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 TAF2Q6P1X5 1199 aa29.04■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.04■■■□□ 2.24
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RP9-201ENST00000297157 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa29.03■■■□□ 2.24
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RP9-201ENST00000297157 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.03■■■□□ 2.24
RP9-201ENST00000297157 FDPSP14324 419 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
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RP9-201ENST00000297157 ARP10275 920 aa29.02■■■□□ 2.24
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RP9-201ENST00000297157 TIGD5Q53EQ6 642 aa29.02■■■□□ 2.24
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RP9-201ENST00000297157 SEPT1Q8WYJ6 367 aa29.02■■■□□ 2.24
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RP9-201ENST00000297157 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
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RP9-201ENST00000297157 CD320Q9NPF0 282 aa29.01■■■□□ 2.23
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RP9-201ENST00000297157 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
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RP9-201ENST00000297157 TUBE1Q9UJT0 475 aa29■■■□□ 2.23
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RP9-201ENST00000297157 GHRP10912 638 aa28.99■■■□□ 2.23
RP9-201ENST00000297157 PLA2G5P39877 138 aa28.99■■■□□ 2.23
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RP9-201ENST00000297157 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.99■■■□□ 2.23
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RP9-201ENST00000297157 TMEM31Q5JXX7 168 aa28.96■■■□□ 2.23
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RP9-201ENST00000297157 DTNBO60941 627 aa28.94■■■□□ 2.22
RP9-201ENST00000297157 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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RP9-201ENST00000297157 CYP3A7P24462 503 aa28.94■■■□□ 2.22
RP9-201ENST00000297157 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
RP9-201ENST00000297157 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
RP9-201ENST00000297157 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa28.94■■■□□ 2.22
RP9-201ENST00000297157 WASF1Q92558 559 aa28.94■■■□□ 2.22
RP9-201ENST00000297157 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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