RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Armc2Q3URY6 854 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt87Q6IMF0 495 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nek8Q91ZR4 698 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gjb6P70689 261 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ap5z1Q3U829 807 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem247Q497K7 211 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 WhammQ571B6 793 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rccd1Q8BTU7 377 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sugp2Q8CH09 1067 aa14.9□□□□□ -0.02
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm379J3QQ19 296 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Foxp2P58463 714 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Psmg1Q9JK23 289 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Qser1A2BIE1 1698 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Chil3O35744 398 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sh3gl2Q62420 352 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kif11Q6P9P6 1052 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 N4bp3Q8C7U1 537 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rtn3Q9ES97 964 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tpp1O89023 562 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 P4hbP09103 509 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Upf3bQ3ULL6 472 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cib4Q9D9N5 185 aa14.89□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt24A1L317 512 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 C2cd2E9Q3C1 696 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ddit3P35639 168 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Arl4cP61208 192 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trim38Q5SZ99 471 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 TrhQ62361 256 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Thoc1Q8R3N6 657 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lonrf3Q9D4H7 753 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slit3Q9WVB4 1523 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atp2c2A7L9Z8 944 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Top3aO70157 1003 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PorP37040 678 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Adora1Q60612 326 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bst2Q8R2Q8 172 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MrgbpQ9DAT2 204 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lrriq4A6H6A4 596 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc27a3O88561 667 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sema3fO88632 785 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rab17P35292 214 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc7a1Q09143 622 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfm4Q3UZZ4 505 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NfkbibQ60778 359 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 HarsQ61035 509 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt72Q6IME9 520 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Q8C1R3 189 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lrrc14Q8VC16 493 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 FtcdQ91XD4 541 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NptxrQ99J85 493 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem165P52875 323 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pfdn6Q03958 127 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf667Q2TL60 609 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Garnl3Q3V0G7 1038 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Letm2Q7TNU7 480 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Smap1Q91VZ6 440 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Chmp2aQ9DB34 222 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Chek2Q9Z265 546 aa14.88□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Scgb2b7D3YYY1 112 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm1661E9Q963 441 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sestd1Q80UK0 696 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Catsper3Q80W99 395 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pak4Q8BTW9 593 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Armcx6Q8K3A6 301 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eid1Q9DCR4 169 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Txnrd1Q9JMH6 613 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt78E9Q0F0 1068 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GckP52792 465 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Palm2Q8BR92 376 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ParnQ8VDG3 624 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Apobec2Q9WV35 224 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gbp11A9YVJ5 442 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MaeaQ4VC33 396 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PolnQ7TQ07 864 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Haus8Q99L00 373 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cops2P61202 443 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 HomezQ80W88 542 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pstpip2Q99M15 334 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rnf14Q9JI90 485 aa14.87□□□□□ -0.03
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.8 ms