RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 RaraP11416 462 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sox10Q04888 466 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fdxacb1Q3UY23 622 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4933427I04RikQ3V053 235 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hspa4Q61316 841 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Herc4Q6PAV2 1057 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc78D3Z5T1 437 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm38392E9Q2A2 434 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krt86P97861 486 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc2a13Q3UHK1 637 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trak2Q6P9N8 913 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BcamQ9R069 622 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prl2c2P04095 224 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gpd2Q64521 727 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ncoa7Q6DFV7 943 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hgh1Q8C3I8 393 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rtp1Q8C8C1 263 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Grin3bQ91ZU9 1003 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 H2afxP27661 143 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf652Q5DU09 608 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Islr2Q5RKR3 745 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rusc1Q8BG26 893 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc9b1Q8C0X2 565 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MtrrQ8C1A3 696 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prpmp5E9PXN1 296 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rasip1Q3U0S6 961 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 March6Q6ZQ89 909 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plagl2Q925T4 496 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc96Q9CR92 584 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10436L7N1Y3 520 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nr1i3O35627 358 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pou2f2Q00196 463 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Emc10Q3TAS6 258 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmtc1Q3UV71 942 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Haus4Q8BFT2 363 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sh2b2Q9JID9 621 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cpb1B2RS76 415 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn2r78K7N6U5 853 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PurbO35295 324 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kcna2P63141 499 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Yy1Q00899 414 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pbxip1Q3TVI8 727 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adam39Q7M762 756 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankrd24Q80VM7 985 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdc23Q8BGZ4 597 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dqx1Q924H9 718 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Josd2Q9CR30 188 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eya4Q9Z191 616 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Skint7A7XV04 395 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Serpina1aP07758 413 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Serpina1bP22599 413 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igfbp4P47879 254 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Psmc6P62334 389 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Psmb7P70195 277 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Serpina1cQ00896 412 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Serpina1dQ00897 413 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trappc3lQ4KL14 181 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp2r5cQ60996 524 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cct6bQ61390 531 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sema4bQ62179 823 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tlr13Q6R5N8 991 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmco3Q8BH01 678 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spata32Q8C5V0 334 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sgms1Q8VCQ6 419 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znhit2Q9QY66 399 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ube3aO08759 870 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgap6O54834 987 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp9aO70228 1047 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim43cP86449 446 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dph1Q5NCQ5 438 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gas7Q60780 421 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Foxn1Q61575 648 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bbs7Q8K2G4 715 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf131Q8K3J5 619 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Uap1Q91YN5 522 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krt36B1AQ75 473 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm28042B7ZCM9 1014 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmigd3G3X8R9 209 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rit2P70425 217 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Taf1bP97358 586 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm1587Q3UT80 123 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5169Q5M8P2 212 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc142Q8CAI1 738 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NapgQ9CWZ7 312 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AurkbO70126 345 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ifnar1P33896 590 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SlmapQ3URD3 845 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fgd3O88842 733 aa25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.2 ms