RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 MEIS1O00470 390 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 POLR2MP0CAP2 368 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 GIT2Q14161 759 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 KIAA1328Q86T90 577 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM160B2Q86V87 743 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 NELFCDQ8IXH7 590 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EPHB6O15197 1021 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CST9Q5W186 159 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TBC1D5Q92609 795 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 WRNIP1Q96S55 665 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 DOCK1Q14185 1865 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 MYH11P35749 1972 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 KRT86O43790 486 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CHMP4BP1P59074 171 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CYP4A11Q02928 519 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 JAKMIP2Q96AA8 810 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 REEP2Q9BRK0 252 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 WDR18Q9BV38 432 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 FEM1BQ9UK73 627 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CEP350Q5VT06 3117 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EML1O00423 815 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ASNSP08243 561 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ERCC3P19447 782 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 NEK11Q8NG66 645 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 KLRG1Q96E93 195 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC42Q96M95 316 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EYA4O95677 639 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 AMPD2Q01433 879 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 DGKZQ13574 1117 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 BAP1Q92560 729 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TFR2Q9UP52 801 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 MYH10P35580 1976 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 LRRC53A6NM62 1247 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CASP5P51878 434 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNMA1Q12791 1236 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PPP2R5CQ13362 524 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 SFR1Q86XK3 245 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.151e-6■□□□□ 11.1
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC5A5Q92911 643 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EPC1Q9H2F5 836 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 BHMT2Q9H2M3 363 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CETN3O15182 167 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 PSMD10O75832 226 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 VAV2P52735 878 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 TUBB4BP68371 445 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 ADAM9Q13443 819 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 SPA17Q15506 151 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 RRAGAQ7L523 313 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC155Q8N6L0 562 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 HSD17B14Q9BPX1 270 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 RGL1Q9NZL6 768 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM184BQ9ULE4 1060 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 MYO6Q9UM54 1294 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-212ENST00000559974 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms