RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498163.1

RPL23AP55-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 55, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP55, Length 452 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP55-201ENST00000498163 TMEM177Q53S58 311 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ICE2Q659A1 982 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CPXCR1Q8N123 301 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 AHI1Q8N157 1196 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 FAM168AQ92567 244 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 E2F7Q96AV8 911 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PEX11GQ96HA9 241 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SMURF1Q9HCE7 757 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 BTG4Q9NY30 223 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 INTUQ9ULD6 942 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 COQ6Q9Y2Z9 468 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SHTN1A0MZ66 631 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 TRAF5O00463 557 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PEX10O60683 326 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZBTB7AO95365 584 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PYGMP11217 842 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 GNAT1P11488 350 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PDE6AP16499 860 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ITKQ08881 620 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 DHCR24Q15392 516 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 FIGNQ5HY92 759 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ADGRF1Q5T601 910 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 STEAP3Q658P3 488 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CREB3L3Q68CJ9 461 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 MIB1Q86YT6 1006 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PASD1Q8IV76 773 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 USP33Q8TEY7 942 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SLC39A13Q96H72 371 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PKNOX2Q96KN3 472 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SRPK3Q9UPE1 567 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 A0A1W2PQJ5 194 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 TCRBV5S2A0A599 114 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 M0R2C6 588 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 KRIT1O00522 736 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 MAN2B1O00754 1011 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 MAFKO60675 156 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 F2P00734 622 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 APPP05067 770 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 DSG1Q02413 1049 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 KCTD2Q14681 263 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CRY1Q16526 586 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CFAP100Q494V2 611 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 DGKHQ86XP1 1220 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CNPY4Q8N129 248 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CHST14Q8NCH0 376 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 TTC8Q8TAM2 541 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 KCNJ15Q99712 375 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 CDH19Q9H159 772 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 PALD1Q9ULE6 856 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.53□□□□□ -1.68
RPL23AP55-201ENST00000498163 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.52□□□□□ -1.69
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RPL23AP55-201ENST00000498163 NUDT19A8MXV4 375 aa4.52□□□□□ -1.69
RPL23AP55-201ENST00000498163 F8W031 263 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms