RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM86B1	E9PN63	330 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TREH	O43280	583 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	HBP1	O60381	514 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	LGR5	O75473	907 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	AMH	P03971	560 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	JAK3	P52333	1124 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ODR4	Q5SWX8	454 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEB	Q6S5H4	581 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	APBB2	Q92870	758 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	IL17RA	Q96F46	866 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM161B	Q96MY7	647 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RIT2	Q99578	217 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TMOD1	P28289	359 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RABEP1	Q15276	862 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ME3	Q16798	604 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	LETM2	Q2VYF4	491 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246		Q4G0T1	1027 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246		Q7L0L9	218 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	NEK8	Q86SG6	692 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	NME8	Q8N427	588 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RDM1	Q8NG50	284 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF576	Q9H609	170 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	COL1A2	P08123	1366 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TLL1	O43897	1013 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG7	O95352	703 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL10	P02778	98 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSH	P09668	335 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	INSRR	P14616	1297 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RASIP1	Q5U651	963 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	NECAB1	Q8N987	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	USP38	Q8NB14	1042 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	PBX4	Q9BYU1	374 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	DISC1	Q9NRI5	854 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CHMP2A	O43633	222 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FOSL2	P15408	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXC8	P31273	242 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	MCM2	P49736	904 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCB4	Q15147	1175 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	INF2	Q27J81	1249 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	C8orf34	Q49A92	452 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RPAIN	Q86UA6	219 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM20A	Q96MK3	541 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP7D2	Q96T17	732 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	MSH4	O15457	936 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEB2	O15479	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	NBN	O60934	754 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC24B	O95487	1268 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP3A7	P24462	503 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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