RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492742.5

WDR4-207, Transcript of WD repeat domain 4, humanhuman

TSL 2

Gene WDR4, Length 2,205 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4-207ENST00000492742 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.13■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.13■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 AKR1B10O60218 316 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 GBP3Q9H0R5 595 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 FAM86B1E9PN63 330 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 NFKBIEO00221 500 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 PJA2O43164 708 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 MOCS3O95396 460 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CIITAP33076 1130 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 TRIM58Q8NG06 486 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 DEF6Q9H4E7 631 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CEP72Q9P209 647 aa22.12■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 TLR2O60603 784 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 ASNSP08243 561 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 TACC1O75410 805 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 GNA14O95837 355 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CASP5P51878 434 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 GIT2Q14161 759 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 JADE2Q9NQC1 790 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SNX12Q9UMY4 172 aa22.11■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 MEIS1O00470 390 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CYP3A4P08684 503 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 RPA1P27694 616 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 MAGEA1P43355 309 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CASP8Q14790 479 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 APBA1Q02410 837 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CREG2Q8IUH2 290 aa22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 MSH4O15457 936 aa22.09■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.09■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 FAM160B2Q86V87 743 aa22.09■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.09■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 HOXD13P35453 343 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 ADAM9Q13443 819 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 TNFAIP1Q13829 316 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 FAM20AQ96MK3 541 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 VAV3Q9UKW4 847 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SHTN1A0MZ66 631 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 GYS2P54840 703 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 RASA3Q14644 834 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 ERMNQ8TAM6 284 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CAGE1Q8TC20 777 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 TEPSINQ96N21 525 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 REEP2Q9BRK0 252 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 FEM1BQ9UK73 627 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.08■■□□□ 1.13
WDR4-207ENST00000492742 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 PRLRP16471 622 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 COG1Q8WTW3 980 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 DRC1Q96MC2 740 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 DNM3Q9UQ16 869 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 ERICH4A6NGS2 130 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 SERPING1P05155 500 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 C2orf54Q08AI8 447 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 SFR1Q86XK3 245 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 GANQ9H2C0 597 aa22.07■■□□□ 1.12
WDR4-207ENST00000492742 RASSF7Q02833 373 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms