RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 I6L893 689 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MEIS1O00470 390 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJC6O75061 913 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SAP30O75446 220 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 WDR47O94967 919 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CHRNB1P11230 501 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MSR1P21757 451 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 POU1F1P28069 291 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ADH7P40394 386 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DNM2P50570 870 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MLLT10P55197 1068 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ERVFRD-1P60508 538 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ROR1Q01973 937 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RASSF7Q02833 373 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ST3GAL1Q11201 340 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 NR5A1Q13285 461 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TNK1Q13470 666 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MTF1Q14872 753 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TBR1Q16650 682 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DUSP5Q16690 384 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PTPN21Q16825 1174 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 KIF19Q2TAC6 998 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SNAI3Q3KNW1 292 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 GPR158Q5T848 1215 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CDCP2Q5VXM1 449 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 B3GNT9Q6UX72 402 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 GSG1LQ6UXU4 331 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF813Q6ZN06 617 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RNF111Q6ZNA4 994 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF497Q6ZNH5 498 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 FERMT3Q86UX7 667 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 FAM83AQ86UY5 434 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PARP8Q8N3A8 854 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PRR18Q8N4B5 295 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 LRRN4Q8WUT4 740 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 KLRG1Q96E93 195 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM11Q96F44 468 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CYYR1Q96J86 154 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TEKT5Q96M29 485 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 NEUROD6Q96NK8 337 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 FIZ1Q96SL8 496 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 C19orf43Q9BQ61 176 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 KLHDC3Q9BQ90 382 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MENTQ9BUN1 341 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 APOL5Q9BWW9 433 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 OSBPL7Q9BZF2 842 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 IKZF5Q9H5V7 419 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 UCK1Q9HA47 277 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ENAMQ9NRM1 1142 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TSKSQ9UJT2 592 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 FZD1Q9UP38 647 aa-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SLIT2O94813 1529 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DYSFO75923 2080 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DSCAML1Q8TD84 2053 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GUL7 405 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CTAGE9A4FU28 777 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 FAM170BA6NMN3 283 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 AHRRA9YTQ3 701 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 H3BMH7 237 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 KLK8O60259 260 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEC1O60732 1142 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DEDDO75618 318 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 JTBO76095 146 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SEC24AO95486 1093 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 FSHBP01225 129 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CHGBP05060 677 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 LAG3P18627 525 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM23P36406 574 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 THPOP40225 353 aa-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RBM25P49756 843 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.5 ms