RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	NUP120	P35729	1037 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	CAF4	P36130	643 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	MRPL37	P36532	105 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	ARP1	P38696	384 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	YJL070C	P40361	888 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	PMT6	P42934	759 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	YGR015C	P53208	328 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	RTS3	P53289	263 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	GAS3	Q03655	524 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	CRN1	Q06440	651 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	ATG29	Q12092	213 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	GET4	Q12125	312 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CPR4	YCR069W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TPK2	P06245	380 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	MRP13	P12686	339 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YSR3	P23501	404 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PHO3	P24031	467 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RAD14	P28519	371 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	BMT2	P38278	337 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	AYR1	P40471	297 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SER33	P40510	469 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PRM2	P40534	656 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	IMA5	P40884	581 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RET2	P43621	546 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GTO1	P48239	356 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SNF12	P53628	566 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TAF12	Q03761	539 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	HFD1	Q04458	532 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YPS7	Q06325	596 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.4	□□□□□ -1.71	not detected
CPR4	YCR069W	IZH3	Q07959	543 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	MUM3	Q08750	479 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	NMD4	Q12129	218 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	COX3	P00420	269 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ATP6	P00854	259 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	COS2	P0CX12	379 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	COS3	P0CX13	379 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SEC63	P14906	663 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	OCA4	P25366	362 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	MRPL9	P31334	269 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SIN4	P32259	974 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YMC1	P32331	307 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TFC1	P32367	649 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	HES1	P35843	434 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ELF1	P36053	145 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RRN3	P36070	627 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	IST2	P38250	946 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	COS4	P43542	379 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GAT1	P43574	510 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YJR030C	P47101	745 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	EMC4	P53073	190 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	USE1	P53146	245 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	FRE4	P53746	719 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RIM13	Q03792	727 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	EMI1	Q04406	187 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	HSP31	Q04432	237 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RRN11	Q04712	507 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	DYN3	Q04949	312 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	COS7	Q07788	383 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ESA1	Q08649	445 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	APC9	Q12107	265 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SUL2	Q12325	893 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ZIP1	P31111	875 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	DGR2	P32330	852 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YDR089W	P38966	869 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YEL073C	P39974	107 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	BUD8	P41698	603 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TOM22	P49334	152 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	COG2	P53271	262 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	DSL1	P53847	754 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YNL140C	P53910	189 aa		4.38	□□□□□ -1.71

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