RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 POLLQ9UGP5 575 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 F13A1P00488 732 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 FERP16591 822 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 TNFAIP3P21580 790 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 DSG3P32926 999 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 PPM1AP35813 382 aa6.9□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 RALAP11233 206 aa6.89□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 PNPLA4P41247 253 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.89□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 NME8Q8N427 588 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 UCMAQ8WVF2 138 aa6.89□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 AXLP30530 894 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGAP4P98171 946 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 CYP4A11Q02928 519 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 DPH6Q7L8W6 267 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 PHKBQ93100 1093 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 HVCN1Q96D96 273 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 YME1L1Q96TA2 773 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 DGAT1O75907 488 aa6.89□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 CES5AQ6NT32 575 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.89□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 XYLBO75191 536 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 FGF19O95750 216 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 PFKMP08237 780 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 CTR9Q6PD62 1173 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 TTC16Q8NEE8 873 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 PARVGQ9HBI0 331 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 ZBTB22O15209 634 aa6.88□□□□□ -1.31
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SMAD4-212ENST00000591126 NR3C2P08235 984 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 MFAP3P55082 362 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 MAP9Q49MG5 647 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC51Q96ER9 411 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 NCK2O43639 380 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 CACNB3P54284 484 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF543Q08ER8 600 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 GIT2Q14161 759 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 SPRYD7Q5W111 196 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 APOA5Q6Q788 366 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 ITIH5Q86UX2 942 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-212ENST00000591126 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.88□□□□□ -1.31
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