RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEB2H3BUK9 544 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PDHXO00330 501 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS20O76081 388 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ERVK-9P63128 1117 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ERVK-24P63145 666 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 GPBP1Q86WP2 473 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 NACC1Q96RE7 527 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP2AO43633 222 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP9AO75110 1047 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 LYPLA2O95372 231 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SFNP31947 248 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 JAK3P52333 1124 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 FANCCQ00597 558 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT76Q01546 638 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTN2Q02246 1040 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP4A11Q02928 519 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 STXBP2Q15833 593 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 GNPTABQ3T906 1256 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ARSHQ5FYA8 562 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 DYMQ7RTS9 669 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 NELFBQ8WX92 580 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNA2P16389 499 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 STK4Q13043 487 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 TPH2Q8IWU9 490 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 B4DLN1 442 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMA7O14818 248 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP1A3P13637 1013 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 PANK4Q9NVE7 773 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2C8P10632 490 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 FCER1AP12319 257 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 STX17P56962 302 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 COASYQ13057 564 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 GIT2Q14161 759 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 LXNQ9BS40 222 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR64B1ANS9 1081 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 CBFA2T2O43439 604 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 CCNE1P24864 410 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 HUNKP57058 714 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 CCNA1P78396 465 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP19Q99542 508 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 KCND2Q9NZV8 630 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNKQ9P0W0 207 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 CCNE2O96020 404 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 TPM3P06753 285 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 IDEP14735 1019 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD2Q14681 263 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 MORC4Q8TE76 937 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 FGD4Q96M96 766 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 PASKQ96RG2 1323 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 BICDL2A1A5D9 508 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 TTI2Q6NXR4 508 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms