RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564601.5

RNPS1-210, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene RNPS1, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-210ENST00000564601 CERS4Q9HA82 394 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-210ENST00000564601 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-210ENST00000564601 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-210ENST00000564601 NID2Q14112 1375 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 RPS6KB1P23443 525 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 KRT40Q6A162 431 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 USP26Q9BXU7 913 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 THEGQ9P2T0 379 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 STXBP3O00186 592 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 LPXNO60711 386 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 IGFBP4P22692 258 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 PSMA5P28066 241 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ADCY7P51828 1080 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 FBXL16Q8N461 479 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ASB2Q96Q27 587 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 BARHL2Q9NY43 387 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 SP4Q02446 784 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 MTMR1Q13613 665 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 COL4A6Q14031 1691 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 SETD4Q9NVD3 440 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 KAT6AQ92794 2004 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 SMCO2A6NFE2 343 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ADAMTS3O15072 1205 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 LGR5O75473 907 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 GJB5O95377 273 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 THPOP40225 353 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 JADE2Q9NQC1 790 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 MAFGO15525 162 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 TLL1O43897 1013 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 SCG2P13521 617 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 KCNJ6P48051 423 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 AP3B2Q13367 1082 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 PGBD1Q96JS3 809 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 PCYT2Q99447 389 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 ANO3Q9BYT9 981 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 BRWD1Q9NSI6 2320 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 NCOR1O75376 2440 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-210ENST00000564601 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 RSPH10BP0C881 870 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 GRB10Q13322 594 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 CTSHP09668 335 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 GNAT1P11488 350 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 RUFY3Q7L099 469 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 TMEM260Q9NX78 707 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 EMSYQ7Z589 1322 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 ESYT2A0FGR8 921 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 LINC01553A4QN01 128 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 SREBF1P36956 1147 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 EVCP57679 992 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 MGAT3Q09327 533 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 FAM26DQ5JW98 314 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-210ENST00000564601 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms