RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MIIPQ5JXC2 388 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CFAP58Q5T655 872 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 WDR59Q6PJI9 974 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 USP37Q86T82 979 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 ADGRF4Q8IZF3 695 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 C3orf20Q8ND61 904 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 WHAMMQ8TF30 809 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 COG1Q8WTW3 980 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 STAMQ92783 540 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 SHISA4Q96DD7 197 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 DYNLL2Q96FJ2 89 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MASTLQ96GX5 879 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CHP1Q99653 195 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 JMJD4Q9H9V9 463 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 TUFT1Q9NNX1 390 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 EMILIN3Q9NT22 766 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 TMOD2Q9NZR1 351 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 ECM29Q5VYK3 1845 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 NHSQ6T4R5 1651 aa5.5□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MYMKA6NI61 221 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 USP17L5A8MUK1 530 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MAPK13O15264 365 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 HSF2BPO75031 334 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PLA2G4BP0C869 781 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 GYS1P13807 737 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 FERP16591 822 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 LMNB1P20700 586 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PRKCIP41743 596 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 SLC1A4P43007 532 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 TNNI2P48788 182 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 GTF2IP78347 998 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 SLC20A2Q08357 652 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PAK2Q13177 524 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 ADAM9Q13443 819 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MTMR3Q13615 1198 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CUL1Q13616 776 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MCM6Q14566 821 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MTF1Q14872 753 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PPP2R5AQ15172 486 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 NAB2Q15742 525 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 ZSCAN26Q16670 478 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 EMC10Q5UCC4 262 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 FKBP1CQ5VVH2 108 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 STYK1Q6J9G0 422 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PDXDC1Q6P996 788 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 RRAGAQ7L523 313 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM160B2Q86V87 743 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 FBXO11Q86XK2 927 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CCDC26Q8TAB7 109 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 TBC1D5Q92609 795 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CAVIN3Q969G5 261 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CNKSR1Q969H4 720 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CCDC102AQ96A19 550 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 LRRC45Q96CN5 670 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 C8orf37Q96NL8 207 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 PLVAPQ9BX97 442 aa5.49□□□□□ -1.53
AC024909.1-201ENST00000549278 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms