RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RPTORQ8N122 1335 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 B4DLN1 442 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MEIS1O00470 390 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FDX1P10109 184 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MUTP22033 750 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 NF2P35240 595 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 MTMR2Q13614 643 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC41Q15345 812 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TSG101Q99816 390 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.1□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PNMA2Q9UL42 364 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRFP10586 1907 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TTC26A0AVF1 554 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 NFIBO00712 420 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 KIF20AO95235 890 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 EYA4O95677 639 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC175P0C221 793 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 BCRP11274 1271 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 KRT9P35527 623 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 GIT2Q14161 759 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MTF1Q14872 753 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RETREG2Q8NC44 543 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 NUP58Q9BVL2 599 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FLOT1O75955 427 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 BACE1P56817 501 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CYP4A11Q02928 519 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SPP2Q13103 211 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MAN2A1Q16706 1144 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FIGNQ5HY92 759 aa9.09□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC7Q99615 494 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 COL20A1Q9P218 1284 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.09□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 GAS7O60861 476 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 SLITRK3O94933 977 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 PTPRAP18433 802 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ERVK-24P63145 666 aa9.08□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.08□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 IQCDQ96DY2 449 aa9.08□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.08□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 RGL1Q9NZL6 768 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PASKQ96RG2 1323 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.08□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.08□□□□□ -0.96
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