RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 FLT1P17948 1338 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 RGL2O15211 777 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 SLURP2P0DP57 97 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 PLCG1P19174 1290 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 SPDL1Q96EA4 605 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 PIGSQ96S52 555 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 USP17L5A8MUK1 530 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 MTMR8Q96EF0 704 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 GDF3Q9NR23 364 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 USP21Q9UK80 565 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 SMCO2A6NFE2 343 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 TECP42680 631 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 GSTO1P78417 241 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 EHHADHQ08426 723 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 POLLQ9UGP5 575 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 FCER1AP12319 257 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 GNAQP50148 359 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 RHBDL3P58872 404 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 PTPROQ16827 1216 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 WHAMMQ8TF30 809 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 GGA2Q9UJY4 613 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 MYH1P12882 1939 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 F8W031 263 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 PICALMQ13492 652 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 TTI2Q6NXR4 508 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 NOD2Q9HC29 1040 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.77□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 EPHB6O15197 1021 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 CDC25CP30307 473 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 TRAPPC3O43617 180 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 TNFRSF8P28908 595 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 SLC1A4P43007 532 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 PDE4DQ08499 809 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 STK4Q13043 487 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 CABP7Q86V35 215 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 TBCKQ8TEA7 893 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 NHSQ6T4R5 1651 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 LRRC53A6NM62 1247 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 RAD51CO43502 376 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 PALMO75781 387 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 HSD17B3P37058 310 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 ARID5AQ03989 594 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 CD302Q8IX05 232 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 RAPGEF5Q92565 580 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 COA7Q96BR5 231 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 MXD3Q9BW11 206 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 P2RX5Q93086 422 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 UIMC1Q96RL1 719 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 GGA1Q9UJY5 639 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 RIMBP2O15034 1052 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 LDHCP07864 332 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 OR52Z1P0C646 297 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-212ENST00000488380 RNF217Q8TC41 542 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms