RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487320.5

CLHC1-212, Transcript of clathrin heavy chain linker domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLHC1, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GSTA4O15217 222 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PCDHGA12O60330 932 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 CFBP00751 764 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 BMP3P12645 472 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PAMP19021 973 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 CCND1P24385 295 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 CYP2C19P33261 490 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 KDM5CP41229 1560 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PHC1P78364 1004 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GTF2H3Q13889 308 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 LRRC32Q14392 662 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 MBTPS1Q14703 1052 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 ODF1Q14990 250 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 TERF2Q15554 542 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 CEP162Q5TB80 1403 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 BROXQ5VW32 411 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 MFSD4AQ8N468 514 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 C2orf69Q8N8R5 385 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 TIFAQ96CG3 184 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.95□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 AGLP35573 1532 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 ERC2O15083 957 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 LTFP02788 710 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 ST5P78524 1137 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GALEQ14376 348 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PJA1Q8NG27 643 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GIMAP7Q8NHV1 300 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 EVI5LQ96CN4 794 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 BOCQ9BWV1 1114 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 USP21Q9UK80 565 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 MYO5CQ9NQX4 1742 aa5.94□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 DVL2O14641 736 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 ASGR2P07307 311 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 SYPP08247 313 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GSTM1P09488 218 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 RXRBP28702 533 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 IREB2P48200 963 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GPR158Q5T848 1215 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PAOXQ6QHF9 649 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 RASSF3Q86WH2 238 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 Q8N1Y9 231 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 RUNDC1Q96C34 613 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 REREQ9P2R6 1566 aa5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 MYO1BO43795 1136 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 AMY2AP04746 511 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PDE6AP16499 860 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 VCAM1P19320 739 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 AMY2BP19961 511 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GPR3P46089 330 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 HTRA3P83110 453 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 LSAMPQ13449 338 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 MORC3Q14149 939 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GRM3Q14832 879 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 CRY1Q16526 586 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 GAB4Q2WGN9 574 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.92□□□□□ -1.46
CLHC1-212ENST00000487320 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms