RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLCO1A2P46721 670 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT81Q14533 505 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGSNQ5TDP6 509 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOL6Q9BWW8 343 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E9PMD0 336 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RXRBP28702 533 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC170Q8IYT3 715 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6V0A1Q93050 837 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF8O76064 485 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MXI1P50539 228 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFAP3P55082 362 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VGLL3A8MV65 326 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 P4HA1P13674 534 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATF2P15336 505 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSTNP61366 133 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SULF1Q8IWU6 871 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAM2O75886 525 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAP43P17677 238 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HADHQ16836 314 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTERF2Q49AM1 385 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.03■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP17L10C9JJH3 530 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CIB2O75838 187 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASP8Q14790 479 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEPT2Q15019 361 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UTYO14607 1347 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF609O15014 1411 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT172Q9UG01 1749 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 I3L4J1 428 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPF2Q92785 391 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NACA2Q9H009 215 aa18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C21orf2O43822 256 aa18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK4P31152 587 aa18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COA1Q9GZY4 146 aa18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HESX1Q9UBX0 185 aa18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PASKQ96RG2 1323 aa18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADRA2BP18089 450 aa18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPHB4P54760 987 aa18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS72Q15906 364 aa18.02■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK36Q9NRP7 1315 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC63Q05C16 580 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD65E5RJM6 399 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPN9O14815 690 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP49Q70CQ1 688 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACCSQ96QU6 501 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEGF6O75095 1541 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTF1Q14872 753 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POTEB3A0JP26 581 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POTECB2RU33 542 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT88Q13099 833 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALX1Q15699 326 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POTEBQ6S5H4 581 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.01■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGALS16A8MUM7 142 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 hCG_1984214I3L0E3 225 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD58P19256 250 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0YCG3 227 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SENP2Q9HC62 589 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC26A0AVF1 554 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TDP2O95551 362 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPING1P05155 500 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLTAP09496 248 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms