RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 BORAQ6PGQ7 559 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 LGI4Q8N135 537 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 SPC25Q9HBM1 224 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 FBLN1P23142 703 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 MASP1P48740 699 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GABREP78334 506 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PRR5P85299 388 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PTPROQ16827 1216 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 STYK1Q6J9G0 422 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 FAM124AQ86V42 546 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NETO2Q8NC67 525 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 MFSD3Q96ES6 412 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 IFT57Q9NWB7 429 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CLDND1Q9NY35 253 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 EFCAB14O75071 495 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 VIL1P09327 827 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 X6R8D5 127 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF536O15090 1300 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 H7BY64 318 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 RAPGEF3O95398 923 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ATF2P15336 505 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 LBX2Q6XYB7 198 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 KRT26Q7Z3Y9 468 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NIM1KQ8IY84 436 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 Q8N1Y9 231 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PEX11GQ96HA9 241 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GPATCH3Q96I76 525 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 JAM3Q9BX67 310 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CDIP1Q9H305 208 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.41□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GPR85P60893 370 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 SURF1Q15526 300 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 MROH9Q5TGP6 573 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 PTPRN2Q92932 1015 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 SGSM2O43147 1006 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 INHBEP58166 350 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 ALG3Q92685 438 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 KCNJ15Q99712 375 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 A0A087X0B3 334 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 KIZQ2M2Z5 673 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 SLC52A2Q9HAB3 445 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 AQP7O14520 342 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 DGKIO75912 1065 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 SOD2P04179 222 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 NAT1P18440 290 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 SDSP20132 328 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 GRK2P25098 689 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 GRK3P35626 688 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 STAT3P40763 770 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 IGBP1P78318 339 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 RBM10P98175 930 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 BRAPQ7Z569 592 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF575Q86XF7 245 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.38□□□□□ -1.713e-7■■■■□ 21.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms