RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 HOXC8P31273 242 aa29.3■■■□□ 2.28
RP9-201ENST00000297157 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
RP9-201ENST00000297157 C8orf34Q49A92 452 aa29.3■■■□□ 2.28
RP9-201ENST00000297157 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.3■■■□□ 2.28
RP9-201ENST00000297157 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
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RP9-201ENST00000297157 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
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RP9-201ENST00000297157 H3BRB1 525 aa29.23■■■□□ 2.27
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RP9-201ENST00000297157 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa29.21■■■□□ 2.27
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RP9-201ENST00000297157 COL4A6Q14031 1691 aa29.18■■■□□ 2.26
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RP9-201ENST00000297157 FOSP01100 380 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
RP9-201ENST00000297157 ADCY7P51828 1080 aa29.18■■■□□ 2.26
RP9-201ENST00000297157 MTUS1Q9ULD2 1270 aa29.18■■■□□ 2.26
RP9-201ENST00000297157 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa29.18■■■□□ 2.26
RP9-201ENST00000297157 AMHP03971 560 aa29.17■■■□□ 2.26
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