RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SPATA33Q96N06 139 aa20.74■□□□□ 0.91
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PTX4-201ENST00000293922 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.74■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 PPFIA4O75335 1185 aa20.73■□□□□ 0.91
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PTX4-201ENST00000293922 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
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PTX4-201ENST00000293922 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.67■□□□□ 0.9
PTX4-201ENST00000293922 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTX4-201ENST00000293922 ATP9AO75110 1047 aa20.67■□□□□ 0.9
PTX4-201ENST00000293922 LGALS2P05162 132 aa20.67■□□□□ 0.9
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PTX4-201ENST00000293922 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.67■□□□□ 0.9
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
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PTX4-201ENST00000293922 MTMR1Q13613 665 aa20.65■□□□□ 0.9
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