RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591265.1

ZNF554-204, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ZNF554, Length 1,148 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-204ENST00000591265 ANTXR2P58335 489 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 TRAF1Q13077 416 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 MBTPS1Q14703 1052 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 SERINC5Q86VE9 423 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 RASEFQ8IZ41 740 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 WNT8BQ93098 351 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 MTMR8Q96EF0 704 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 SPATA33Q96N06 139 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 RGS20O76081 388 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 RSPH10BP0C881 870 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 SAMD11Q96NU1 681 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 ZBTB5O15062 677 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 DDAH1O94760 285 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 THPOP40225 353 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 MAP3K14Q99558 947 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 LY9Q9HBG7 655 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 CCDC69A6NI79 296 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 KLRF2D3W0D1 207 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 CAND2O75155 1236 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 GGPS1O95749 300 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 CALM1P0DP23 149 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 CALM2P0DP24 149 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 CALM3P0DP25 149 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 HOXC8P31273 242 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 HIC1Q14526 733 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 PGM5Q15124 567 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 PTPROQ16827 1216 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 H3BRB1 525 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 CCND2P30279 289 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 KIF5BP33176 963 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 SP2Q02086 613 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 CD320Q9NPF0 282 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF554-204ENST00000591265 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 KCNA5P22460 613 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 FGD1P98174 961 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 TROAPQ12815 778 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 GRM4Q14833 912 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 GJD3Q8N144 294 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 SEPT8Q92599 483 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 TOP1MTQ969P6 601 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 STAM2O75886 525 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 POLR2MP0CAP2 368 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 GNAQP50148 359 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 ANAPC15P60006 121 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 EPC2Q52LR7 807 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 SIP14410 1827 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 PRR33A8MZF0 331 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 H3BNC9 293 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-204ENST00000591265 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms