RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	EPN3	Q9H201	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	AGRP	O00253	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	FBXO24	O75426	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CSF1R	P07333	972 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SELP	P16109	830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PAX3	P23760	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NF2	P35240	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CRK	P46108	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	KCNJ4	P48050	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TM4SF4	P48230	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CHRND	Q07001	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	LRRC14	Q15048	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	AOX1	Q06278	1338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	TPM2	P07951	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	FOXO4	P98177	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NCAPH	Q15003	741 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	MDFI	Q99750	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	MAF1	Q9H063	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	FKTN	O75072	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SBF2-208	ENST00000528478	VAMP4	O75379	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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