RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ICAM1P05362 532 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 IDEP14735 1019 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FECHP22830 423 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CASP14P31944 242 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF76P36508 570 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 UBXN1Q04323 297 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 COASYQ13057 564 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF536O15090 1300 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MYH11P35749 1972 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN12O43309 604 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TPM1P09493 284 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CYP11B2P19099 503 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SLC12A3P55017 1021 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC63Q05C16 580 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 DLK2Q6UY11 383 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MB21D1Q8N884 522 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 WDR18Q9BV38 432 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 POTEFA5A3E0 1075 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TRAF5O00463 557 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 DNM2P50570 870 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 HSD17B4P51659 736 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 GHRHRQ02643 423 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF15Q66K64 600 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 POTEGQ6S5H5 508 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 GPBP1Q86WP2 473 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PANK4Q9NVE7 773 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CEP350Q5VT06 3117 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 KIF18AQ8NI77 898 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF592Q92610 1267 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SLC5A5Q92911 643 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.11□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PCNTO95613 3336 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PSMD10O75832 226 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 USP14P54578 494 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FSTL1Q12841 308 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PPP2R5CQ13362 524 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CEP55Q53EZ4 464 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ARSHQ5FYA8 562 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 HOOK2Q96ED9 719 aa9.11□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.11□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 WDR81Q562E7 1941 aa9.11□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.1□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 MIIPQ5JXC2 388 aa9.1□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CDCA5Q96FF9 252 aa9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.1□□□□□ -0.95
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