RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	KCNK3	O14649	394 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC37A4	O43826	429 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP1R2	P41236	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	SEC23A	Q15436	765 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	NTRK3	Q16288	839 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	GCLM	P48507	274 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	CEP112	Q8N8E3	955 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	LAD1	O00515	517 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ACTN2	P35609	894 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	DISP2	A7MBM2	1401 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	IKBKB	O14920	756 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	FTCD	O95954	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	NPEPPS	P55786	919 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP4C	P60510	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADGRB2	O60241	1585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	IFNB1	P01574	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	LXN	Q9BS40	222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	VPS18	Q9P253	973 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	BCR	P11274	1271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	CEP55	Q53EZ4	464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	VSTM4	Q8IW00	320 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRIM14	Q14142	442 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	MESD	Q14696	234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	C8orf74	Q6P047	294 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	C7orf31	Q8N865	590 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274		K7ERI5	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	COASY	Q13057	564 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	PKN1	Q16512	942 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	CYTH3	O43739	400 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABL1	P00519	1130 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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